微波殺菌是微波直接與物質(zhì)相互作用并將高頻電磁波轉(zhuǎn)換成熱能的過程。微波去菌是微波熱效應(yīng)和生物效應(yīng)的結(jié)果。微波在細(xì)菌膜橫截面上的電勢分布會影響細(xì)胞膜周圍電子和離子的濃度，從而改變細(xì)胞膜的滲透性。結(jié)果，細(xì)菌被營養(yǎng)不良，不能正常代謝，并且其生長和發(fā)育受到阻礙。從生物化學(xué)的角度來看，細(xì)菌正常生長和繁殖的核酸（RNA）和脫氧核糖核酸（DNA）是由幾個氫鍵組成的卷曲大分子。微波引起氫鍵的松弛，斷裂和重組，從而引起遺傳或染色體畸變，甚至斷裂。微波殺菌利用電磁場效應(yīng)和生物效應(yīng)殺死微生物。事實證明，微波設(shè)備在殺菌溫度，殺菌時間，產(chǎn)品質(zhì)量保持，產(chǎn)品保質(zhì)期和節(jié)能方面具有明顯的優(yōu)勢。

       在相同的去菌溫度下，微波去菌所需的時間較短，在相同的去菌條件下，細(xì)菌死亡的溫度較低。同時，可以對被去菌物料進(jìn)行整體去菌，縮短去菌周期，確保去菌過程的一致性和物料的均勻性。

       微波殺菌設(shè)備體積小，占地面積小，操作維護(hù)方便，不需煤，氣等燃料，無需復(fù)雜的管道系統(tǒng)，適用于大多數(shù)行業(yè)。